V poslední době začali někteří uživatelé, kteří přešli na nejnovější iOS, tedy 9.1, pozorovat problémy s Touch ID. Některým iPhonům trvá moc dlouho přečíst otisk a nebo ho nepřečtou vůbec. Uživatelů není moc, ale neustále ohlasy na Touch ID po aktualizaci přibývají.
Před rokem Apple uvedl iOS 8.0.1, který řešil právě stejný problém – skenr otisku prstu nebyl schopný přečíst dotyk. 
